5 жовтня 2025 року Президент Естонії Алар Каріс направив до державного суду закон Про внесення змін до Закону про церкви та парафії, який зобов'язує Естонську християнську Православну Церкву розірвати зв'язки з Московським Патріархатом. Глава держави зажадав визнати документ таким, що суперечить Конституції.

За словами президента країни, прийняті парламентом норми порушують статті 40, 48 і 11 Конституції, обмежуючи свободу віросповідання і об'єднань. Каріс підкреслив, що заборона на «доктринальні зв'язки» з іноземними релігійними центрами надлишковий і може привести до зворотного ефекту — посилення авторитету зарубіжних лідерів серед віруючих. "Якщо держава почне втручатися в навчання і обряди, це не зменшить ризики, а, навпаки, створить нові», — заявив він.

Нагадаємо, законопроект був прийнятий парламентом 17 вересня після кількох відхилень з боку президента. Закон про Церкви зобов'язує релігійні організації змінити свої статути в разі підпорядкування закордонним центрам, діяльність яких влада визнає небезпечною для суверенітету країни. Якщо статут або керівництво об'єднання не будуть приведені у відповідність, парафії зможуть вийти з його складу і зареєструвати нові документи навіть без згоди колишнього центру.

Фактично, за оцінкою спостерігачів, документ спрямований проти Естонської православної християнської Церкви (ЕПХЦ). Представники влади заявляли, що в разі відмови ЕПХЦ виконувати вимоги закону можливе судове переслідування і фактична заборона її діяльності.

На тлі судового розгляду митрополит Талліннський і всієї Естонії Євген благословив духовенство на посилену молитву. У храмах Таллінна з 6 по 12 жовтня будуть щодня відбуватися молебні та акафісти з молитвами про Естонську православну християнську церкву. "Закликаємо всіх парафіян суто молитися за нашу Церкву", - йдеться у зверненні митрополита.

Конфлікт навколо Естонської Церкви загострився в травні 2024 року, коли парламент Естонії оголосив Російську Православну Церкву (РПЦ) інститутом, що підтримує спеціальну військову операцію Росії на Україні. Пізніше Лаурі Ляенеметс, який займав тоді пост глави МВС Естонії, заявив, що розраховує на розрив відносин між Естонською православною церквою Московського патріархату (нині ЕПХЦ) і Російської Церкви і визнання з боку ЕПХЦ діяльності Московського Патріархату єрессю. Під тиском влади митрополит Таллінський Євген був змушений покинути єпархію і виїхати в Росію — йому не продовжили посвідку на проживання. Представники Естонської Православної Церкви виступали в ООН із заявами про порушення прав віруючих. Підтримку Естонської Церкви неодноразово висловлювали представники Помісних Церков по всьому світу.