Ο Άγιος Ισαάκ (στον κόσμο, Ιβάν Ιβάνοβιτς Αντιμόνοφ) γεννήθηκε στις 31 Μαΐου 1810 στο Κουρσκ, σε μια ευσεβή οικογένεια εμπόρων. Οι γονείς του διακρίνονταν από την ειλικρίνεια, τη φιλανθρωπία τους προς τους φτωχούς και την επιμέλεια στην ομορφιά του ναού. Σε μια ατμόσφαιρα αγάπης, υπακοής και αυστηρής χριστιανικής τάξης, σχηματίστηκε ο χαρακτήρας του μελλοντικού αγίου. Από την παιδική του ηλικία, ήταν σεμνός, ευγενικός, σιωπηλός και ταυτόχρονα απλός και πνευματώδης στην επικοινωνία.
Η σκέψη να γίνει μοναχός ωρίμασε στην ψυχή του για πολύ καιρό. Βοηθώντας τον πατέρα του στο εμπόριο, ο Ιβάν Αντιμόνοφ δεν εγκατέλειψε την επιθυμία του να αφιερώσει τη ζωή του στον Θεό. Το 1847, σε ηλικία τριάντα έξι ετών, μπήκε στο μοναστήρι του Ερμιτάζ Vvedenskaya Optina ως αρχάριος.
Ο πνευματικός του μέντορας ήταν ο Άγιος Μακάριος της Οπτίνας. Ο αρχάριος Ιωάννης εργάστηκε στο μελισσοκομείο, στο φούρνο και στο μοναστήρι, τραγούδησε στη χορωδία και έδεσε βιβλία. Εκτέλεσε όλα τα καθήκοντα με ζήλο και ταπεινότητα, τηρώντας αυστηρά τον κανόνα προσευχής και τον χάρτη της εκκλησίας. Το 1854 έγινε μοναχός με το όνομα Ισαάκ και το 1858 χειροτονήθηκε ιερομόναχος.
Πριν από το θάνατό του, ο Άγιος Μακάριος ευλόγησε τον πατέρα Ισαάκ να έρθει υπό την πνευματική καθοδήγηση του Αγίου Αμβρόσιου της Οπτίνας. Το 1862, μετά το θάνατο του ηγούμενου της Μονής, του Αγίου Μωυσή, ο πατέρας Ισαάκ έγινε διάδοχός του.
Για περισσότερα από τριάντα χρόνια, ο Άγιος Ισαάκ κυβέρνησε την έρημο Οπτίνα. Οι εκκλησίες βελτιώθηκαν κάτω από αυτόν, χτίστηκε ένα μοναστηριακό νοσοκομείο με φαρμακείο και μια εκκλησία στο όνομα του Αγίου Ιλαρίωνα του Μεγάλου, εμφανίστηκε ένα νέο ξενοδοχείο, ένα βιβλιοπωλείο και άλλα απαραίτητα κτίρια. Μέσω της φροντίδας του ηγούμενου, η οικονομία του μοναστηριού ενισχύθηκε και αναπτύχθηκαν κήποι και Λαχανόκηποι. Στο δεύτερο μισό του 19ου αιώνα, η Optina Pustyn έγινε ένα από τα πιο καλά διατηρημένα μοναστήρια στη Ρωσία.
Ωστόσο, το κύριο καθήκον του μοναχού ήταν η πνευματική φροντίδα των αδελφών. Ως ηγούμενος και από το 1885 ως Αρχιμανδρίτης, ο ίδιος παρέμεινε ο υπάκουος πνευματικός γιος του Γέροντα Αμβρόσιου και δεν ανέλαβε σημαντικά καθήκοντα χωρίς την ευλογία του. "Πατέρες και αδελφοί! Πρέπει να πάτε στον γέροντα για να καθαρίσετε τη συνείδησή σας", υπενθύμισε συχνά στους μοναχούς. Μαζί με όλους τους άλλους, ο ηγούμενος στάθηκε στην ουρά του εξομολογητή του και μίλησε μαζί του, γονατίζοντας σαν απλός αρχάριος.
Τα τελευταία χρόνια της ζωής του μοναχού ήταν γεμάτα ασθένειες και θλίψεις. Αποδυναμωμένος σωματικά, πήρε ιδιωτικά τον τόνο στο μεγάλο σχήμα. Πριν από το θάνατό του, ο Άγιος απευθύνθηκε στους αδελφούς με μια τελική προειδοποίηση: "αγαπάτε τον Θεό και τους γείτονές σας, αγαπάτε την Εκκλησία του Θεού και στην εκκλησιαστική υπηρεσία και προσευχή μην αναζητάτε γήινες αλλά ουράνιες ευλογίες".
Ο Άγιος Ισαάκ της Οπτίνας αναπαύθηκε ειρηνικά στον Κύριο στις 22 Αυγούστου (4 Σεπτεμβρίου) 1894. Ολόκληρη η ζωή του έγινε παράδειγμα ταπεινότητας, ακλόνητης υπακοής, ενεργητικής αγάπης και πιστότητας στις πνευματικές παραδόσεις της ερήμου Οπτίνα.